Le microbiote intestinal (MI) représente une extraordinaire biodiversité, puisqu’il se compose de 10¹³ bactéries, soit autant que le nombre de cellules du corps humain. Le compartiment bactérien est le mieux connu mais on a beaucoup à apprendre sur les autres micro-organismes et les interactions entre eux, comme les phages dirigés contre les bactéries.