La peau humaine est colonisée par une flore bactérienne qui occupe à l’état commensal la surface cutanée, épiderme et annexes pilaires. L’estimation de cette flore varie de 10⁵ à 10⁸ notamment sur les mains, la région la plus riche étant la zone unguéale. C’est dans cette flore résidente que se recrutent les bactéries pathogènes impliquées dans les infections cutanées, deux espèces dominent : Staphylococcus aureus et Streptococcus pyogenes, les autres sont plus rares (autres streptocoques, anaérobies, entérobactéries).