Le risque de thrombose veineuse est un effet indésirable bien connu, rare mais potentiellement grave, lié notamment aux estrogènes. Ce risque est deux fois plus élevé avec les progestatifs dits de troisième ou quatrième génération qu’avec ceux de deuxième génération, au levonorgestrel (5). Raison pour laquelle ces pilules de 3e et 4e générations sont désormais déremboursées. Le risque n’est pas corrélé avec la durée de l’administration, il est maximum la première année, présent dès le premier mois.