Sur le plan de la formation initiale, les épreuves classantes nationales (ECN) ont fait peau neuve en 2016 avec ces examens sur tablettes, une réussite finale qui a donné quelques sueurs froides aux carabins et aux organisateurs.
Autre tournant majeur, la réforme du troisième cycle. Nouveaux DES, réorganisation des maquettes et outils pédagogiques innovants : entamé depuis 2009, le chantier est en passe d'aboutir malgré les tiraillements dans plusieurs spécialités. L'entrée en vigueur est prévue à la rentrée 2017, même si une partie des internes sont en grève depuis mi-avril pour dénoncer un passage en force et réclamer un report.
Plusieurs polémiques liées au cursus auront marqué le quinquennat. Même si ce n'est pas pour cette année, le gouvernement a acté le principe d'un possible tirage au sort des étudiants souhaitant intégrer la PACES dans les facultés en surcharge, provoquant une levée de boucliers chez les carabins et les doyens. Dans un autre registre, l'affaire des touchers pelviens sans consentement, réalisés par des étudiants, a conduit le ministère de la Santé à vouloir équiper chaque CHU d'un centre de simulation en 2017.
Sur le volet sensible des conditions de travail, le gouvernement a donné quelques coups de pouce. La rémunération des gardes des externes a doublé passant de 26 à 52 euros brut en 2016. Le régime d'indemnisation des gardes et astreintes des internes a également été amélioré. La limitation du temps de travail hebdomadaire des internes à 48 heures maximum a enfin été opérée en 2015. Mais son application pose toujours problème dans certains CHU, de même que le strict respect du repos de sécurité. La ministre de la Santé a annoncé l'ouverture du temps de travail additionnel rémunéré (pour les internes volontaires).
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